حسن خمینی، عضو هیات موسس و هیات امنای دانشگاه ازاد اسلامی طی نامه‌ای به رییس جمهور ضمن اعلام فقدان وجاهت قانونی در موضوع عزل رییس دانشگاه آزاد اسلامی و نیز نصب سرپرست جدید بدون رای‌گیری در هیات امنا دانشگاه از وی خواست نسبت به مسئله برای راهگشایی ورود کند.
متن این نامه بشرح زیر است:
بسمه تعالی
جناب حجت الاسلام و المسلمین آقای روحانی
با سلام
به نظر اینجانب روند عزل برادرمان جناب آقاى میرزاده از وجاهت قانونی برخوردار نیست و حداقل آن است که شبهه غیرقانونی بودن آن بسیار قوی است. همچنین نصب سرپرست نیز بدون رای‌گیری در هیات امنا بوده است. ورود حضرتعالی در مسأله حتما مفید و راهگشا خواهد بود.
با تشکر سید حسن خمینی
٩٦/٣/٢