مسعود پزشکیان در سخنرانی خود در صحن علنی مجلس گفت در جریان جنگ ۱۲ روزه جمهوری اسلامی با اسرائیل، او نگران آسیب‌دیدن علی خامنه‌ای بوده است چرا که باور داشته در صورت کشته‌شدن «رهبری» در حمله اسرائیل، در داخل حکومت درگیری درست می‌شد و دیگر نیازی به حمله اسرائیل نبود.
پزشکیان در سخنرانی سه‌شنبه ۲۰ آبان خود در صحن علنی مجلس با اشاره به این موضوع تاکید کرد: «در جنگ ۱۲ روزه هیچ ترسی از اینکه چه اتفاقی رخ بدهد نداشتم اما واهمه داشتم خدایی نکرده اتفاقی برای رهبری رخ بدهد. آن‌وقت ما با همدیگر دعوا می‌کنیم و اصلا لازم نیست اسرائیل بیاید.»
او افزود: «ستون خیمه انقلاب، رهبری است. ما می‌توانیم با هم اختلاف داشته باشیم اما کسی هست که درباره اختلافات می‌گوید این نه یا آن نه. تمام شد و رفت.»
به گفته پزشکیان، جامعه سیاسی ایران هنوز «گفت‌وگو با همدیگر را خوب یاد نگرفته» و به‌جای بحث، به‌راحتی یکدیگر را محکوم و متهم می‌کنند.
او گفت در چنین شرایطی وجود رهبر جمهوری اسلامی عامل اصلی جلوگیری از شکاف و بحران داخلی است.
پزشکیان همچنین گفت همه دیدگاه‌های او در نهایت ذیل همان چارچوبی تعریف می‌شود که رهبر جمهوری اسلامی ترسیم کرده که هدف آن «الگو شدن» جمهوری اسلامی است.
در ماه‌های گذشته شماری از مقام‌های اسرائیل در اظهار نظرهای مختلف، رهبر جمهوری اسلامی را به مرگ تهدید کرده‌اند.
۱۵ آبان، روزنامه اسرائیل‌هیوم در تحلیلی درباره تهدید جمهوری اسلامی علیه اسرائیل نوشت گزینه کشتن خامنه‌ای در جنگ ۱۲ روزه انجام نشد اما همچنان ممکن است.
در پی تهدیدهای اسرائیل به کشتن رهبر جمهوری اسلامی، خامنه‌ای در پیامی از مخفیگاه که سوم مهرماه در رسانه‌های ایران منتشر شد، بر ادامه نبرد تا مرگ تاکید کرد و «شهادت» را پاداش «مجاهدت» خواند.
شبکه ۱۳ اسرائیل، ۲۴ شهریور گزارش داد در جلسه‌ای که شامگاه ۲۲ خرداد با حضور مقام‌های دولتی و نظامی اسرائیل برگزار شد، یافتن فرصتی برای کشتن خامنه‌ای و بی‌ثبات کردن جمهوری اسلامی مورد بررسی قرار گرفته بود.
بر اساس این گزارش، بزالل اسموتریچ، وزیر دارایی این کشور، در جلسه‌ای گفته که باید «رهبر را پیدا کرد».
یسرائیل کاتز، وزیر دفاع، نیز تایید کرده اسرائیل در پی تحقق چنین هدفی بوده اما «فرصت مناسب» به دست نیامده است.
کشتن خامنه‌ای محتمل است
۱۸ شهریور، حمزه صفوی، فرزند یحیی رحیم‌صفوی، مشاور عالی و دستیار نظامی خامنه‌ای، ترور رهبر جمهوری اسلامی را محتمل دانست و گفت حکومت باید برای اقدامات اسرائیل آماده باشد.
وب‌سایت بصیرت، وابسته به معاونت سیاسی سپاه پاسداران، ۲۶ مرداد در تحلیلی درباره جنگ ۱۲ روزه نوشت که اسرائیل و آمریکا به‌دنبال کشتن خامنه‌ای هستند.
وزیر دفاع اسرائیل هم ششم مرداد در سخنانی تهدیدآمیز خطاب به خامنه‌ای هشدار داد که در صورت تداوم تهدیدات جمهوری اسلامی، دست‌های اسرائیل، حتی به شخص او هم خواهد رسید.
کاتز پس از حملات موشکی سپاه پاسداران به مناطق مسکونی تل‌آویو نیز اعلام کرده بود خامنه‌ای با این اقدامات دیگر نمی‌تواند زنده بماند.
بنیامین نتانیاهو، نخست‌وزیر اسرائیل، ۲۶ خرداد درباره احتمال هدف قرار دادن رهبر جمهوری اسلامی به ایران‌اینترنشنال گفت: «وارد جزییات نمی‌شوم تا همه چیز باز باقی بماند.»
دونالد ترامپ، رییس‌جمهوری آمریکا نیز ۲۷ خرداد اعلام کرد از محل اختفای خامنه‌ای آگاه است اما «فعلا» قصد کشتن او را ندارد.
او در پستی در شبکه اجتماعی تروث‌سوشال نوشت: «ما کاملا مطلعیم که به‌اصطلاح “رهبر عالی” کجا پنهان شده؛ او هدفی آسان است، اما در محل فعلی‌اش در امان است. دست‌کم فعلا قصد حذف او را نداریم.»
ایران انیترنشنال