وزارت امور خارجه و سازمان انرژی اتمی ایران در بیانیه‌ای مشترک، گزارش اخیر مدیرکل آژانس بین‌المللی انرژی اتمی (منتشرشده در ۳۱ مه ۲۰۲۵) را محکوم کرده و آن را سیاسی و تحت فشار کشورهای غربی (آمریکا، انگلیس، فرانسه و آلمان) دانستند.
بنا بر ادعای وزارت امور خارجه و سازمان انرژی اتمی، این گزارش که برای نشست شورای حکام آژانس در ژوئن ۲۰۲۵ تهیه شده، منعکس‌کننده سطح واقعی همکاری‌های گسترده ایران با آژانس نیست و اتهامات بی‌اساسی را بر اساس «اسناد جعلی رژیم صهیونیستی» تکرار کرده است.
ایران ضمن رد ادعاهای مربوط به فعالیت‌ها و مکان‌های هسته‌ای اعلام‌نشده، تأکید کرد که همکاری‌های لازم را با آژانس، از جمله اعطای دسترسی به مکان‌های مورد ادعا و ارائه اطلاعات، انجام داده است. همچنین، لغو انتصاب تعداد محدودی از بازرسان آژانس را اقدامی متعارف و در چارچوب حقوق حاکمیتی خود دانست.
بیانیه ایران، گزارش آژانس را به دلیل عدم تفکیک میان تعهدات الزام‌آور پادمانی و تعهدات داوطلبانه برجام، غیرحرفه‌ای و مغایر با اصول بی‌طرفی خواند و استناد به اطلاعات اسرائيل را محکوم کرد. ایران همچنین نسبت به تهدیدات اسرائیل علیه تأسیسات هسته‌ای خود و سکوت مدیرکل آژانس انتقاد کرد.
وزارت امور خارجه و سازمان انرژی اتمی هشدار داده‌اند که هرگونه سوءاستفاده سیاسی از این گزارش، با پاسخ متناسب مواجه خواهد شد و مسئولیت تبعات آن بر عهده کشورهای غربی است. همچنین تأکید کرد که برنامه هسته‌ای‌اش صلح‌آمیز، شفاف و تحت نظارت آژانس است و طبق فتوای رهبر جمهوری اسلامی، سلاح هسته‌ای جایگاهی در دکترین دفاعی ایران ندارد.